L'autorité de gestion doit établir un plan d'évaluation pour chaque programme. Chaque plan d'évaluation doit être validé par le Comité de suivi dans l'année suivant l'approbation du programme.
Les évaluations permettent de se réinterroger sur les pratiques, les outils mis en œuvre, suivre et mesurer l'impact et les résultats des projets soutenus par les fonds européens, mieux articuler les politiques publiques sur le territoire et préparer les programmations futures.